Büyük ve karmaşık modellerde önyargı riski artabilir

Bootstrap’un pratik faydaları ile birlikte, özellikle yüksek boyutlu verisetlerinde veya bağımlı gözlemlerde önyargı oluşma riski vardır. Bu nedenle sonuçlar, orijinal veri setinin temsil gücüyle doğrudan ilişkilidir ve yanlış varsayımlar sonucu güvenilirlik azalabilir.